Come confrontare più di due proporzioni in un esperimento di germinazione?

[Luke57]

Sto analizzando i dati di un piccolo esperimento che ho fatto sulla germinazione di alcuni semi con diverse condizioni di luce. Ho calcolato le percentuali di successo per tre gruppi e ora vorrei capire se le differenze che vedo sono significative o potrebbero essere solo casuali. Mi chiedo se esista un modo semplice per confrontare più di due proporzioni contemporaneamente, forse qualcosa che vada oltre il classico test del chi-quadro per l'indipendenza. I miei dati sono in una tabella a tre righe per due colonne e non sono sicuro di come procedere.

[AaronVR]

Per confrontare tre proporzioni contemporaneamente puoi usare il test di omogeneità del chi-quadro su una tabella 3x2. Controlla se le proporzioni di germinazione sono uguali tra i tre gruppi; se una cella ha conteggi attesi molto piccoli, preferisci un test esatto di Fisher per tabelle r x c. La parola chiave è proporzioni.

[David.S]

Attenzione: con campioni piccoli il chi-quadro può dare risultati fuorvianti. Un'alternativa più robusta è la regressione logistica binomiale: modelli la probabilità di germinazione come funzione del gruppo di luce e ottieni un test globale sull'effetto del gruppo, oltre a stime di odds ratio.

[Penelope.R]

Se l'ordinamento tra le condizioni è rilevante, puoi usare il test di tendenza di Cochran-Armitage per verificare una possibile tendenza nelle proporzioni al variare della luce.

[Madison_W]

Se l'analisi globale mostra differenze, puoi fare confronti a coppie tra gruppi con test su due proporzioni e correggere i p-value per molteplici confronti (Holm o Bonferroni) per controllare l'errore di tipo I.

[Abigail_D]

Forse è utile riformulare: la luce cambia la probabilità di germinazione e in che modo? La domanda di fondo resta sulle proporzioni e su come interpretare le differenze osservate.

[BrandonRM]

Se vuoi una guida pratica veloce, considera partire da una regressione logistica o dal chi-quadro, verifica le condizioni (conteggi attesi), e chiediti se i confronti post-hoc sono sensati; in ogni caso le proporzioni sono al centro dell'analisi.