Sto lavorando alla mia tesi magistrale in biologia molecolare e mi trovo a dover scegliere un metodo per quantificare l'espressione genica in campioni molto degradati. Il mio relatore mi ha suggerito di considerare l'RNA-Seq, ma ho letto che con RNA di bassa qualità i dati potrebbero essere molto rumorosi. Qualcuno di voi si è trovato in una situazione simile? Mi chiedo se, nonostante le limitazioni del materiale di partenza, valga comunque la pena tentare con un protocollo di RNA-Seq ottimizzato per campioni degradati, o se sia meglio ripiegare su tecniche più tradizionali e forse meno ambiziose.
Cosa scegliere tra RNA-Seq e tecniche tradizionali per campioni degradati?
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Cosa scegliere tra RNA-Seq e tecniche tradizionali per campioni degradati?
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